Whole genome sequencing of locally advanced and metastatic breast carcinoma unravels relevant molecular signatures and novel events.
Résumé
Cette étude a réalisé un séquençage du génome entier et du transcriptome sur 50 échantillons de tumeurs de 37 patientes atteintes d'un cancer du sein localement avancé ou métastatique. Elle a révélé une complexité génomique étendue, avec une charge mutationnelle tumorale plus élevée dans le cancer du sein triple négatif (TNBC). Une déficience de la recombinaison homologue (HRD) a été détectée chez 27% des patientes, souvent sans mutations de BRCA1/2 mais avec des variants structurels délétères dans d'autres gènes de réparation. Des altérations thérapeutiquement exploitables ont été identifiées chez 84% des patientes, incluant une nouvelle fusion ESR1::EP300 potentiellement liée à la résistance endocrinienne. Ces résultats soulignent la valeur du séquençage pangénomique pour caractériser la maladie métastatique et guider les thérapies.
Analyse
Cette étude est d'une importance capitale pour la prise en charge du cancer du sein métastatique, car elle démontre la valeur du séquençage du génome entier pour identifier des signatures moléculaires et des altérations génomiques complexes qui ne sont pas toujours détectées par des approches plus limitées. La découverte de mécanismes de déficience de la recombinaison homologue (HRD) non liés à BRCA1/2 et d'une nouvelle fusion ESR1::EP300 ouvre des pistes pour de nouvelles cibles thérapeutiques et des stratégies de traitement personnalisées, notamment pour surmonter la résistance endocrinienne. L'identification d'altérations exploitables chez une large proportion de patientes justifie l'implémentation plus large du séquençage pangénomique dans la pratique clinique pour les cancers avancés.