TERT

Cette étude internationale visait à identifier des biomarqueurs pronostiques génétiques chez des patients atteints de neuroblastome de risque intermédiaire, âgés de plus de 18 mois, sans amplification de MYCN, avec des tumeurs localisées non résécables ou de stade 3 et une histologie défavorable, qui présentent des pronostics inférieurs. Les chercheurs ont analysé les altérations du nombre de copies chromosomiques, le séquençage ADN de nouvelle génération, les mécanismes de maintien des télomères et l'expression génique. Les résultats ont montré que les amplifications d'oncogènes, les altérations de la voie p53 et les aberrations chromosomiques segmentaires typiques (tSCA) sont des marqueurs pronostiques indépendants associés à une survie sans événement et une survie globale significativement réduites. Ces découvertes suggèrent que ces patients pourraient bénéficier de traitements intensifiés ou alternatifs.

Cette étude évalue la performance des outils de prédiction in silico pour la curation des variants génétiques dans un panel de gènes de prédisposition au cancer. Les chercheurs ont appliqué les seuils recommandés par le groupe de travail ClinGen SVI et les prédictions d'AlphaMissense à des variants de gènes comme BRCA1, BRCA2, TP53, TERT et ATM, dont la pathogénicité ou la bénignité est établie. Les résultats ont révélé une sensibilité insuffisante pour les variants pathogènes de TERT et les variants bénins de TP53. L'étude souligne que la performance de ces outils peut être spécifique à chaque gène et dépend des jeux de données d'entraînement utilisés. Il est donc crucial de valider ces outils pour des gènes individuels, en particulier pour les variants faux-sens.

Cette étude rétrospective monocentrique a évalué l'impact pronostique de la méthylation du promoteur de MGMT et des mutations du promoteur de TERT chez 54 patients atteints de glioblastome de grade 4. Les résultats montrent que la méthylation de MGMT est associée à une meilleure survie globale, tandis que les mutations de TERT sont liées à une survie plus courte. L'étude confirme également l'effet bénéfique de la chimioradiothérapie adjuvante. Une stratification combinée de ces deux biomarqueurs permet d'identifier quatre sous-groupes pronostiques distincts, les patients avec MGMT méthylé et TERT de type sauvage ayant la survie la plus longue.

Cette étude compare les caractéristiques cliniques et la survie entre les glioblastomes IDH-sauvages définis moléculairement (MolGBM) et histologiquement (HistGBM). Elle caractérise également les tumeurs astrocytaires de grade inférieur IDH-sauvages sans altérations génomiques définissant le glioblastome. Les MolGBM ont montré une survie globale ajustée plus favorable (HR 0,40) par rapport aux HistGBM, en particulier chez les patients de 60 ans et plus. Ces résultats soulignent l'hétérogénéité clinique et biologique des gliomes diffus IDH-sauvages et l'importance de la caractérisation moléculaire. Les tumeurs astrocytaires IDH-sauvages de grade inférieur sans altérations définissant le glioblastome nécessitent une exploration moléculaire approfondie.

Cette étude rétrospective a examiné la fréquence et les profils moléculaires des carcinomes urothéliaux (CU) conventionnels de la vessie positifs pour PAX8. Sur 101 cas, 10% se sont avérés PAX8-positifs par immunohistochimie. Une analyse par séquençage de nouvelle génération (NGS) a été réalisée sur 20 cas, incluant tous les CU PAX8-positifs. Les résultats ont révélé que les CU PAX8-positifs présentaient des mutations du promoteur de TERT, des altérations de TSC1, des pertes de NOTCH1 et WT1 plus fréquemment, et une absence de perte de RB1, contrairement aux CU PAX8-négatifs. Ces découvertes suggèrent un profil moléculaire distinct pour les CU PAX8-positifs, soulignant la nécessité de prudence dans l'interprétation diagnostique de PAX8.

Cette étude évalue l'impact du séquençage de nouvelle génération (NGS) sur le diagnostic des tumeurs mélanocytaires inactivées par BAP1 (BIMT), qui présentent souvent une atypie morphologique rendant leur classification difficile. Une enquête menée auprès de dermatopathologistes a montré que l'intégration des résultats NGS améliorait significativement la précision diagnostique et la concordance interobservateur. Des altérations génomiques spécifiques, telles que des variants pathogènes de TERT-p, CDKN2A, PTEN et l'amplification de MYC, ont été associées aux cas malins. Ces résultats suggèrent que le NGS pourrait affiner le diagnostic des mélanomes, ce qui est crucial pour l'accès aux thérapies ciblées.

Les mutations somatiques dans les régions promotrices riches en GC sont des moteurs importants du cancer, mais leur détection est difficile en raison de la faible couverture de séquençage dans ces zones. Cette étude présente un essai de capture hybride optimisé pour plus de 3000 promoteurs de gènes liés au cancer, permettant un séquençage profond de ces régions complexes. Cette méthode facilite la découverte de mutations ponctuelles fiables, de petites insertions/délétions, de variants du nombre de copies et de signatures mutationnelles. L'essai a identifié des mutations non codantes candidates dans les gènes CDK4, SMAD3 et GATA3 dans le cancer du sein, ouvrant la voie à de futures investigations fonctionnelles.